眼の進化と生物多様性を研究しています。
The eye is one of the most elaborate organs in animals and the study of its evolution is of particular interest. It has been difficult to understand how this complex organ arose. Molluscs provide a good example of the application of evolutionary genomics, as all eye types have evolved in one lineage.
Tag: #Evolution #Eye #Molluscs #Research #Bioinfo #Papers #Photo #Movie #Link

 

今年度はこの学会で発表します。

小倉か吉田が下記学会で発表予定です。見かけたらお声がけください。

5/23-28: Gordon Research Conference -Visual System Development

7/4-8: SMBE2010

8/2-5: 進化学会

9/20-23: 遺伝学会

9/23-25: 動物学会

12/7-10: 分子生物学会

DNA解読、高速化に道=電流で塩基識別-大阪大 - 時事通信

この技術を応用すれば、現在3カ月かかるヒトの全遺伝情報(ゲノム)が1日で解読できるという。21日付の英科学誌「ネイチャー・ナノテクノロジー」電子版で発表した。 DNAは二重のらせん構造で、アデニン、グアニン、シトシン、チミンの塩基が連なっている。 

右と左で性が違う:「雌雄モザイク」ニワトリの研究

Brandon Keim


鏡の前にいる雌雄モザイク・ニワトリ。雄の側は白く、雌の側は茶色。Photos:Roslin Institute, University of Edinburgh.

研究環境 論文編

論文の管理 - Papers

PapersはMacの文献管理ソフトです。Pubmedなどで文献検索をして、そのままPDFを取り込むことができます。その際自動的にタイトル, Abstractなども取り込むため検索しやすくなります。Collection機能を使えばスマートフォルダのように特定のキーワードの論文をまとめておくこともできます。Bibliography機能もついており、各種フォーマットにExport可能です。ユーザーインターフェースも洗練されていて使いやすいです。論文保存場所をDropBoxにしておけば、ラボでも家でも同じ論文を読むことができます。

論文情報の収集 1 - Pubmed

いわずとしれたPubMed。Papersを使えばPapers内でPubmed検索できます。

論文情報の収集 2 - BaRf

様々な雑誌のRSS(新着情報)をまとめてあります。

論文情報の共有 1 - Citeulike

興味のある論文がみつかれば 1クリックでその情報を自分のライブラリに追加できます。論文出版で有名なSpringerのサービス。日本版のSesameというものもあり。

論文情報の共有 2 - Connotea

論文のソーシャルブックマーク。

論文紹介の公開 - Twitter

読むだけだともったいないので、紹介記事を書きましょう。論文紹介用サービスではないですが、Twitterを使います。140字という字数制限がみそです。

ほかにもいろいろあると思いますが、とりあえず。

研究環境 共有編

Google calendar

複数人数のスケジュール共有にはオンラインカレンダーが便利です。

いくつか種類がありますが、なかでもGoogle Calenderは使いやすさ、ほかのサービスとの連携で有利でしょう。

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Dropbox

DropBoxを使えば、ラボでも家でもほかの人のデータでも簡単にシェアできます。

自分のコンピューターで作成したデータは即座にオンラインストレージに同期され、どこでどんな作業をしても常に最新のデータで作業できます。

  • 大量データの共有 - ファイル共有 (Macの場合)

ファイル共有

DropBoxではさすがに大量のデータを同期すれば時間がかかりますが、LAN内であればMacのファイル共有で大容量データも簡単にシェアできます。ネットワーク越しの共有はいろいろと面倒なのでその場合は上のDropBoxを使います。

  • プロジェクト/ストラテジーの共有 - MindMeister

MindMeister

様々な研究のアイデア、戦略を練るにはオンラインのマインドマップツールを使います。