Ogura Lab

Nanopore DNA sequencing

Sun, 19 Feb 2012 13:03:35 +0900

Nanopore DNA sequencing

各所で話題になっていますが、USBメモリサイズの新世代DNAシーケンサー”MiniION”と19インチラッ...

Sun, 19 Feb 2012 13:02:20 +0900

各所で話題になっていますが、USBメモリサイズの新世代DNAシーケンサー”MiniION”と19インチラックサイズの”GridION”が発表されました。

詳しくはリンク先をみていただくとして、

miniIONは使い捨てタイプのUSBメモリサイズシーケンサー
miniIONは値段は$900以下で2012年中に登場
48kbのGenomeであればGapなしに決定、100kbも読める!?
GridIONは19インチラックにおさめるシーケンサー
データ量はGridIONが2000nanopore(2012, 2013には8000nanopore)で1.4Gb/h(24時間以上可能で1Run 33.6Gb~)
MinIONが512nanoporeで150Mb/h(6h可能で1Run 900Mb)
Error rateは4%ほど

だそうです。

ここの解説が読みやすいです。

RNA direct sequencingもできるようで、ついに使い捨てシーケンサー時代の到来です。

ハエトリグモはピンぼけから距離を認識する。寺北先生らの論文です。

Fri, 03 Feb 2012 18:14:33 +0900

ハエトリグモはピンぼけから距離を認識する。

寺北先生らの論文です。

Dropbox容量アップボーナス

Thu, 02 Feb 2012 20:20:22 +0900

Dropbox使っているヒトはForum build(開発最新版)をインストールして新機能のPhoto uploadを使ってみてください。

デジカメやiPhoneなどをDropboxをインストールしてあるPC/Macにつなぐたびに自動的にDropboxにもアップロードされるようになります。

500MBアップロードするごとに500MB容量が追加されます。最高4.5GBまでだそうです。

開発版のダウンロード先:

http://forums.dropbox.com/topic.php?id=52900&replies=24

Dropboxを使っていないヒトはこちらから登録してみてください。双方の容量が追加されます。

http://db.tt/hdJOaDps

Staring into the Beautiful Cold-Blooded Eyes of Reptiles

Fri, 20 Jan 2012 22:00:05 +0900

Staring into the Beautiful Cold-Blooded Eyes of Reptiles

Baby Octopus crawling around out of water

Wed, 21 Dec 2011 19:15:47 +0900

Baby Octopus crawling around out of water

RNA interference

Mon, 19 Dec 2011 15:36:53 +0900

RNA interference

Symposium of Genomic Conservation and Diversity of Organisms

Wed, 07 Dec 2011 11:26:57 +0900

今週末台湾 National Cheng Kung Universityで開かれるシンポジウムで話してきます。

ハーバード大が開発した軟体動物ロボット

Tue, 06 Dec 2011 22:00:06 +0900

ハーバード大が開発した軟体動物ロボット

まぐろゲノム

Tue, 29 Nov 2011 10:02:24 +0900

12/8のCIBセミナーはまぐろゲノムを研究されている中村洋路博士に講演してもらいます。ご興味のある方はぜひ詳細をお問い合わせください。

InCob2011で発表してきます。

Mon, 28 Nov 2011 17:49:23 +0900

InCob2011で発表してきます。:

マレーシア・クアラルンプールで開催です。

16:30~ Effective gene collection from the metatranscriptome of marine microorganisms by A Ogura, M Lin, Y Shigenobu, A Fujiwara, K Ikeo and S Nagai

12/6にはUCSIのLecture series “Current Topics in Biotechnology”で講義してきます。

鷹の眼はそれほど鋭くない？

Thu, 03 Nov 2011 14:08:50 +0900

鷹の眼はそれほど鋭くない？

文京区３大学新技術説明会で発表します

Thu, 27 Oct 2011 09:29:57 +0900

文京区３大学新技術説明会で発表します:

場所: JSTホール (市ヶ谷)

発表: 14:05~ 新規遺伝子検出用マイクロアレイを利用した有用遺伝子探索法

Animal Eyes Gallery

Fri, 21 Oct 2011 16:48:39 +0900

Animal Eyes Gallery

動物学会に参加します

Fri, 16 Sep 2011 20:10:00 +0900

動物学会に参加します:

9/21 18:00~20:30 関連集会海のパフォーマー K1-3 小倉

9/22 13:00~15:30 ポスター 2P017 吉田

Video

Fri, 16 Sep 2011 09:01:44 +0900

SMBE2011

Mon, 08 Aug 2011 10:29:12 +0900

SMBE2011

#e_genomics もうすぐRegistrationを閉め切ります。

Fri, 29 Jul 2011 15:20:46 +0900

多数のご登録ありがとうございました。

オンサイトの当日受付は予定していますが、会場一番後ろの椅子のみの席や立ち見になる可能性がありますのでご了承ください。

Dear #smbe2011 participants, Come and attend #E_genomics

Tue, 26 Jul 2011 23:39:37 +0900

Please check and regist at http://e-genomics.org/, if you have a time on 1-2 August in Tokyo.

Fascinating talks on evolutionary genomics by the following invited speakers:

Yasuhiro Go, Kyoto University

Jun Gojobori, Graduate University for Advanced Studies

Valer Gotea, National Human Genome Research Institute

Tokumasa Horiike, Shizuoka University

Naoki Irie, RIKEN

Philipp Khaitovich, Shanghai Insitute of Biological Sciences

Wen-ya Ko, University of Pennsylvania

Johannes Krause, Universität Tübingen

Sudhir Kumar, Arizona State University

Shigehiro Kuraku, University of Konstanz

Aoife McLysaght, Trinity College Dublin

Hisao Moriya, Okayama University

So Nakagawa, National Institute of Genetics

Scott Rifkin, University of California, San Diego

Jun Sese, Tokyo Institute of Technology

Kentaro Shimizu, Zurich University

Shin-Han Shiu, Michigan State University

Yong Woo, University of Chicago

Jianzhi George Zhang, University of Michigan

Abstract book #E_genomics

Tue, 26 Jul 2011 23:33:02 +0900

Abstract book of Evolutionary Genomics can be downloaded from the website: http://e-genomics.org/

Ogura Lab

Nanopore DNA sequencing

Nanopore DNA sequencing

各所で話題になっていますが、USBメモリサイズの新世代DNAシーケンサー”MiniION”と19インチラッ...

ハエトリグモはピンぼけから距離を認識する。 寺北先生らの論文です。

Dropbox容量アップボーナス

Staring into the Beautiful Cold-Blooded Eyes of Reptiles

Baby Octopus crawling around out of water

RNA interference

Symposium of Genomic Conservation and Diversity of Organisms

ハーバード大が開発した軟体動物ロボット

まぐろゲノム

InCob2011で発表してきます。

鷹の眼はそれほど鋭くない？

文京区３大学新技術説明会で発表します

Animal Eyes Gallery

動物学会に参加します

Video

SMBE2011

#e_genomics もうすぐRegistrationを閉め切ります。

Dear #smbe2011 participants, Come and attend #E_genomics

Abstract book #E_genomics

ハエトリグモはピンぼけから距離を認識する。寺北先生らの論文です。