Ogura Lab

• Research

There are several types of eyes in morphology such as camera eye, compound eye, mirror eye, and single lens eye, and all the eye types have been evolved from the same origin, the prototype eye. Even though there are conserved genes and networks in the eye evolution, little is known about what kinds of genetic basis have been contributed to the eye diversification. It is essential for discovering genes for the morphological diversification to develop a platform of genomic and transcriptomic comparison among species. We, therefore, developed microarray that cover the genes related to development, function, and structure of molluscan eye, as an example, for the evolutionary genomic studies.

Research topics:

1. Diversification and evolution of molluscan eye
2. Convergent evolution of camera eye
3. Evolutionary mechanism of animal diversification

Methods:

1. Comparative genomics using next-generation sequencers
2. Comparative transcriptome using inter-species microarray
3. Molecular evolution and bioinformatics
4. Developmental biology utilizing pygmy squid

動物の眼は、単眼、複眼、カメラ眼など複雑な形態が同一起源から発達し、動物の進化そのものに大きく貢献してきたが、その形態多様化のメカニズムは知られていない。大量の遺伝子発現情報を種間で直接比較する方法を考案し、動物の眼の形態多様化メカニズムを研究する。一つの系統の中で多様な眼の形態をもっている軟体動物を材料に眼の多様化メカニズムを研究する。

1. 軟体動物の眼の多様性
2. カメラ眼の収斂進化の分子メカニズム
3. 形態多様化の進化メカニズム

研究手法としては下記を中心に進めています。

1. 次世代シーケンスを利用した比較ゲノム
2. マイクロアレイを利用した比較トランスクリプトーム
3. 分子進化とバイオインフォマティクス
4. ヒメイカを利用した発生遺伝学

• Members

Atsushi OGURA  (小倉淳): Assistant Professor 特任助教

Masa-aki YOSHIDA (吉田真明): Postdoc 特任リサーチフェロー

Satsuki TAKAGI  (高木さつき): Technician 特任アソシエイトフェロー

Mengjie LIN     (林梦婕): Under-graduate student 学生

• Alumna

Chika SATOH     (佐藤智佳) → 京都大学

Yukiko ISHIKURA     (石藏友紀子) → 京都大学