眼の進化と生物多様性を研究しています。
The eye is one of the most elaborate organs in animals and the study of its evolution is of particular interest. It has been difficult to understand how this complex organ arose. Molluscs provide a good example of the application of evolutionary genomics, as all eye types have evolved in one lineage.
Tag: #Evolution #Eye #Molluscs
#Research
#Bioinfo
#Papers
#Photo
#Movie
#Link
各所で話題になっていますが、USBメモリサイズの新世代DNAシーケンサー”MiniION”と19インチラックサイズの”GridION”が発表されました。
詳しくはリンク先をみていただくとして、
- miniIONは使い捨てタイプのUSBメモリサイズシーケンサー
- miniIONは値段は$900以下で2012年中に登場
- 48kbのGenomeであればGapなしに決定、100kbも読める!?
- GridIONは19インチラックにおさめるシーケンサー
- データ量はGridIONが2000nanopore(2012, 2013には8000nanopore)で1.4Gb/h(24時間以上可能で1Run 33.6Gb~)
- MinIONが512nanoporeで150Mb/h(6h可能で1Run 900Mb)
- Error rateは4%ほど
だそうです。
ここの解説が読みやすいです。
RNA direct sequencingもできるようで、ついに使い捨てシーケンサー時代の到来です。
